La chiesa con annesso un piccolo monastero poggia sui resti del Tempio del Sole. La sua costruzione ebbe inizio sotto il pontificato di Stefano II (752-757) e fu poi ultimata dal fratello Paolo I che la affidò ai Benedettini. Nel XII secolo la chiesa fu detta “in capite” poiché nell’adiacente chiesa di S. Giovannino era venerata la reliquia della testa di San Giovanni Battista.
La chiesa appartiene oggi alla nazione inglese ed è officiata dai Padri Pallottini.